Prilikom odabira potpuno automatske centrifuge treba uzeti u obzir sljedeće čimbenike:
Brzina rotacije i centrifugalna sila: Različiti uzorci zahtijevaju različite brzine rotacije; odabir treba temeljiti na stvarnim potrebama.
Kapacitet: Kapacitet bubnja određuje količinu uzorka koji se obrađuje po ciklusu; industrijske primjene obično zahtijevaju veće kapacitete.
Materijal:-materijali otporni na koroziju (kao što je nehrđajući čelik) prikladni su za obradu kemijskih reagensa ili korozivnih uzoraka.
Održavanje i čišćenje: Jednostavan dizajn olakšava svakodnevno održavanje i čišćenje.